Como presidente do Tribunal Regional Federal da 4ª Região, Carlos Eduardo Thompson Flores, contrariou em julho do ano passado, decisão do desembargador plantonista Rogerio Favretto, que mandou soltar Lula num domingo, e decidiu manter a prisão do ex-presidente, permanecendo na época, a determinação do desembargador relator do caso do tríplex no tribunal, desembargador João Pedro Gebran Neto, de que o petista continuasse a cumprir a pena pela condenação no processo.